L’intitolazione della scuola primaria di Prepo a Giovanni Falcone e Paolo Borsellino risale al 1993. Tale scelta ha come motivazione l’intenzione di affermare il patrimonio educativo che si racchiude nelle loro figure e testimoniare la volontà di associarsi ai loro ideali. I due magistrati hanno creduto  nella ricerca della verità e della giustizia come esigenza e dovere fondamentale per l’uomo e per il cittadino  e hanno dimostrato coerenza e coraggio nell’espletamento delle proprie funzioni sacrificando l’esistenza in nome di una società migliore. 

La scuola si relaziona con agenzie formative di cui si avvale per lo svolgimento delle attività specialistiche che vengono poi inserite all’interno dei percorsi didattici.